A Inspetoria de Profilaxia das Moléstias Infecciosas, foi criada subordinada à Direção Geral do Serviço Sanitário, responsável isolar pacientes com doenças epidêmicas; realizar serviços de limpeza e desinfecção; combater moscas, mosquitos, ratos e outros vetores; organizar e administrar hospitais de isolamento de emergência e outros estabelecimentos similares, incluindo hospitais para pacientes com tuberculose em estágio avançado; e coletar dados para pesquisas epidemiológicas. O isolamento domiciliar era preferido quando possível, com supervisão de enfermeiras sob direção médica, garantindo o cumprimento do isolamento e condições sanitárias adequadas. O policiamento sanitário era coordenado com outras inspetorias para garantir eficiência. A Inspetoria orientava a profilaxia de doenças em todo o estado, podendo atuar diretamente em surtos, e enviando regularmente dados ao Instituto de Higiene da capital. O Desinfetório Central, o Hospital de Isolamento da Capital e o Serviço de Controle de Moscas e Mosquitos passaram a ficar subordinados diretamente à Inspetoria.
Os documentos que integram esta seção contém fichas de notificação compulsória de doenças, específicas para as doenças: peste, verminose, cólera, hanseníase (lepra), impaludismo, malária, febre amarela, tuberculose, disenteria, varicela, varíola, difteria, crupe, febre tifóide, meningite, cérebro-espinhal, tracoma, sífilis e moléstias venéreas, escarlatina, encefalite letárgica, notificação de doença transmissível (geral), ficha médica da criança e ficha social de visita domiciliar, além de um catálogo da biblioteca da Inspetoria.